1896年（日明治29年）

總督府明令禁止採金，再頒布《臺灣鑛業規則》，以雞籠山（今基隆山）為界，劃設東西兩大礦區，以東為「金瓜石礦山」，礦權授予田中長兵衛主持的田中組；以西為「瑞芳礦山」（今九份），授予藤田傳三郎的藤田合名會社。

1897年（日明治30年）

田中組與藤田組著手進行礦山開發。

1904年(日明治37年)

於本山礦床發現稀有的硫砷銅礦，繼而發現蘊藏豐富銅礦藏量的長仁礦床，金瓜石也從金銀礦山轉為「金銀銅礦山」。

1914年（日大正3年）

因產量豐富，臺灣躍升為日本帝國轄下第一大的產金區。同年，基隆人顏雲年租下藤田組於瑞芳礦區之所有礦權，並逐步收購鄰近地區的採礦權，稱霸九份。 **1920年（日大正9年） 顏雲年成立臺陽鑛業株式會社，旗下除了九份之瑞芳金礦，尚有平溪、猴硐煤礦，成為同時掌控金與煤的大企業。

1925年（日大正14年）

受第一次世界大戰影響，金瓜石礦山開發權轉入後宮信太郎主持之金瓜石礦山株式會社。

1933 年（日昭和8年）

日本鑛業株式會社收購金瓜石礦區，成立臺灣礦業株式會社，大舉更新設備，於臨海之水湳洞，沿山建造新式的浮選礦場（今水湳洞選煉廠遺址），並修築水湳洞直通八斗子運礦場的輕便鐵路（今臺鐵深澳線前身），進入採礦全盛期。

1938年（日昭和13年）

金瓜石礦山創下年產值2.6公噸(約六萬八千九百兩)的紀錄，被譽為「亞洲第一貴金屬礦山」。

1942年（日昭和17年）

太平洋戰爭爆發後，金瓜石改以開採軍需之銅礦為主。日軍於此設立戰俘營，前後關押五百餘名以大英國協為主的同盟國戰俘，命其採掘銅礦。